Phim Đại Ngư Hải Đường xoay quanh câu chuyện tình bạn đầy cảm động của các nhân vật: Xuân, Thu và Côn. Xuân và cậu bạn - Thu thuộc về thế giới nơi đáy biển. Trong lần dạo chơi nhân gian vào Lễ Trưởng Thành năm 16 tuổi, Xuân bị mắc kẹt lại, nhờ có cậu bé làng chài cứu giúp nên mới thoát nạn, nhưng không ngờ cậu lại mất mạng bởi cơn sóng dữ. Vì muốn trả ơn, Xuân tìm đến Linh Bà thực hiện một giao dịch, biến linh hồn của cậu thành một chú cá nhỏ rồi gọi là Côn, nuôi dưỡng và tìm cách đưa về trần gian. Tuy vậy đây là việc trái với thiên định, dẫn đến thảm họa hủy diệt, con đường trở về nhân gian của Côn cũng vì vậy mà càng thêm khó khăn. Dưới sự giúp sức của Xuân, Thu và người trong tộc cuối cùng kiếp nạn được giải quyết, Côn trở về với thế giới của mình.
