Nội dung của MARS RED diễn ra vào năm 1923. Bấy giờ, số lượng ma cà rồng (vampire) đã tồn tại được rất lâu bất ngờ đang gia tăng nhanh chóng và một nguồn máu bí ẩn có tên là Ascra đã xuất hiện. Chính phủ Nhật Bản đã thành lập nên Code Zero, một đơn vị quân đội được giao sứ mệnh đánh bại ma cà rồng. Dưới sự thành lập của Trung tướng Nakajima, đơn vị này trước kia là đơn vị cung cấp thông tin trong thế chiến, nhưng đã được bàn giao lại để giải quyết cuộc “bùng nổ dân số” phiên bản ma cà rồng
